El trabajo con las municipalidades sistematiza los instrumentos metodológicos en lo que se ha denominado la Caja de Herramientas de Desarrollo económico Local. La Caja de Herramientas a la fecha esta compuesto por los siguientes instrumentos metodológicos:

• Manual para la creación y organización de la Gerencia de Desarrollo Económico Local
  
• Manual para la creación de la Unidad Municipal para el Desarrollo Empresarial
  
• Manual para la elaboración de diagnósticos y planes participativos de conglomerados MYPES.
  
• Manual para la organización del Directorio de Empresas Locales
  
• Manual para la Simplificación Administrativa de la Licencia Municipal de Funcionamiento.
  
• Manual para la organización de Ferias de Productores Locales.

En el marco de la promulgación de la Ley Orgánica de Municipalidades 27972, PROMDE hizo importantes aportes en los capítulos relacionados a la promoción del Desarrollo Económico Local. La ley, establece nuevos retos a los gobiernos locales y la posibilidad de PROMDE de apoyar de una manera mas estructural estos procesos.